BLOSUM matrix examples
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BLOSUM 30
A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z * A 4 0 -3 0 0 -2 0 -2 0 0 -1 1 0 -1 1 -1 1 1 1 -5 0 -4 0 -7 B 0 5 -2 5 0 -3 0 -2 -2 0 -1 -2 4 -2 -1 -2 0 0 -2 -5 -1 -3 0 -7 C -3 -2 17 -3 1 -3 -4 -5 -2 -3 0 -2 -1 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -6 0 -7 D 0 5 -3 9 1 -5 -1 -2 -4 0 -1 -3 1 -1 -1 -1 0 -1 -2 -4 -1 -1 0 -7 E 0 0 1 1 6 -4 -2 0 -3 2 -1 -1 -1 1 2 -1 0 -2 -3 -1 -1 -2 5 -7 F -2 -3 -3 -5 -4 10 -3 -3 0 -1 2 -2 -1 -4 -3 -1 -1 -2 1 1 -1 3 -4 -7 G 0 0 -4 -1 -2 -3 8 -3 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -2 0 -2 -3 1 -1 -3 -2 -7 H -2 -2 -5 -2 0 -3 -3 14 -2 -2 -1 2 -1 1 0 -1 -1 -2 -3 -5 -1 0 0 -7 I 0 -2 -2 -4 -3 0 -1 -2 6 -2 2 1 0 -3 -2 -3 -1 0 4 -3 0 -1 -3 -7 K 0 0 -3 0 2 -1 -1 -2 -2 4 -2 2 0 1 0 1 0 -1 -2 -2 0 -1 1 -7 L -1 -1 0 -1 -1 2 -2 -1 2 -2 4 2 -2 -3 -2 -2 -2 0 1 -2 0 3 -1 -7 M 1 -2 -2 -3 -1 -2 -2 2 1 2 2 6 0 -4 -1 0 -2 0 0 -3 0 -1 -1 -7 N 0 4 -1 1 -1 -1 0 -1 0 0 -2 0 8 -3 -1 -2 0 1 -2 -7 0 -4 -1 -7 P -1 -2 -3 -1 1 -4 -1 1 -3 1 -3 -4 -3 11 0 -1 -1 0 -4 -3 -1 -2 0 -7 Q 1 -1 -2 -1 2 -3 -2 0 -2 0 -2 -1 -1 0 8 3 -1 0 -3 -1 0 -1 4 -7 R -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -1 -3 1 -2 0 -2 -1 3 8 -1 -3 -1 0 -1 0 0 -7 S 1 0 -2 0 0 -1 0 -1 -1 0 -2 -2 0 -1 -1 -1 4 2 -1 -3 0 -2 -1 -7 T 1 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 0 -1 0 0 1 0 0 -3 2 5 1 -5 0 -1 -1 -7 V 1 -2 -2 -2 -3 1 -3 -3 4 -2 1 0 -2 -4 -3 -1 -1 1 5 -3 0 1 -3 -7 W -5 -5 -2 -4 -1 1 1 -5 -3 -2 -2 -3 -7 -3 -1 0 -3 -5 -3 20 -2 5 -1 -7 X 0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 0 0 0 0 0 -1 0 -1 0 0 0 -2 -1 -1 0 -7 Y -4 -3 -6 -1 -2 3 -3 0 -1 -1 3 -1 -4 -2 -1 0 -2 -1 1 5 -1 9 -2 -7 Z 0 0 0 0 5 -4 -2 0 -3 1 -1 -1 -1 0 4 0 -1 -1 -3 -1 0 -2 4 -7 * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 1
BLOSUM 62
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 0 -4 R -1 5 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -4 N -2 0 6 1 -3 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -4 D -2 -2 1 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 C 0 -3 -3 -3 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -4 Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 0 3 -1 -4 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -1 -4 H -2 0 1 -1 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 0 0 -1 -4 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 -3 -3 -1 -4 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -4 -3 -1 -4 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 0 1 -1 -4 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -2 -1 -1 -1 -1 1 -3 -1 -1 -4 F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 -3 -3 -1 -4 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -1 -2 -4 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 0 0 0 -4 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 -1 -1 0 -4 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 1 -4 -3 -2 11 2 -3 -4 -3 -2 -4 Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 -3 -2 -1 -4 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 -3 -2 -1 -4 B -2 -1 3 4 -3 0 1 -1 0 -3 -4 0 -3 -3 -2 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 Z -1 0 0 1 -3 3 4 -2 0 -3 -3 1 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 X 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -4 * -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 1
BLOSUM 90
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * A 5 -2 -2 -3 -1 -1 -1 0 -2 -2 -2 -1 -2 -3 -1 1 0 -4 -3 -1 -2 -1 -1 -6 R -2 6 -1 -3 -5 1 -1 -3 0 -4 -3 2 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 -3 -2 0 -2 -6 N -2 -1 7 1 -4 0 -1 -1 0 -4 -4 0 -3 -4 -3 0 0 -5 -3 -4 4 -1 -2 -6 D -3 -3 1 7 -5 -1 1 -2 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -6 -4 -5 4 0 -2 -6 C -1 -5 -4 -5 9 -4 -6 -4 -5 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -4 -2 -4 -5 -3 -6 Q -1 1 0 -1 -4 7 2 -3 1 -4 -3 1 0 -4 -2 -1 -1 -3 -3 -3 -1 4 -1 -6 E -1 -1 -1 1 -6 2 6 -3 -1 -4 -4 0 -3 -5 -2 -1 -1 -5 -4 -3 0 4 -2 -6 G 0 -3 -1 -2 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -3 -4 -5 -5 -2 -3 -2 -6 H -2 0 0 -2 -5 1 -1 -3 8 -4 -4 -1 -3 -2 -3 -2 -2 -3 1 -4 -1 0 -2 -6 I -2 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -4 5 1 -4 1 -1 -4 -3 -1 -4 -2 3 -5 -4 -2 -6 L -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -4 1 5 -3 2 0 -4 -3 -2 -3 -2 0 -5 -4 -2 -6 K -1 2 0 -1 -4 1 0 -2 -1 -4 -3 6 -2 -4 -2 -1 -1 -5 -3 -3 -1 1 -1 -6 M -2 -2 -3 -4 -2 0 -3 -4 -3 1 2 -2 7 -1 -3 -2 -1 -2 -2 0 -4 -2 -1 -6 F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -5 -2 -1 0 -4 -1 7 -4 -3 -3 0 3 -2 -4 -4 -2 -6 P -1 -3 -3 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -4 8 -2 -2 -5 -4 -3 -3 -2 -2 -6 S 1 -1 0 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -2 5 1 -4 -3 -2 0 -1 -1 -6 T 0 -2 0 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -2 1 6 -4 -2 -1 -1 -1 -1 -6 W -4 -4 -5 -6 -4 -3 -5 -4 -3 -4 -3 -5 -2 0 -5 -4 -4 11 2 -3 -6 -4 -3 -6 Y -3 -3 -3 -4 -4 -3 -4 -5 1 -2 -2 -3 -2 3 -4 -3 -2 2 8 -3 -4 -3 -2 -6 V -1 -3 -4 -5 -2 -3 -3 -5 -4 3 0 -3 0 -2 -3 -2 -1 -3 -3 5 -4 -3 -2 -6 B -2 -2 4 4 -4 -1 0 -2 -1 -5 -5 -1 -4 -4 -3 0 -1 -6 -4 -4 4 0 -2 -6 Z -1 0 -1 0 -5 4 4 -3 0 -4 -4 1 -2 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 0 4 -1 -6 X -1 -2 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2 -2 -1 -2 -6 * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1