https://teaching.healthtech.dtu.dk/22111/index.php?action=history&feed=atom&title=BLOSUM_matrix_examples 2026-04-11T00:47:41Z Revision history for this page on the wiki MediaWiki 1.41.0 https://teaching.healthtech.dtu.dk/22111/index.php?title=BLOSUM_matrix_examples&diff=83&oldid=prev 2024-03-13T16:12:13Z

<p>Created page with &quot;==BLOSUM 30== &lt;pre&gt; A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z * A 4 0 -3 0 0 -2 0 -2 0 0 -1 1 0 -1 1 -1 1 1 1 -5 0 -4 0 -7 B 0 5 -2 5 0 -3 0 -2 -2 0 -1 -2 4 -2 -1 -2 0 0 -2 -5 -1 -3 0 -7 C -3 -2 17 -3 1 -3 -4 -5 -2 -3 0 -2 -1 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -6 0 -7 D 0 5 -3 9 1 -5 -1 -2 -4 0 -1 -3 1 -1 -1 -1 0 -1 -2 -4 -1 -1 0 -7 E 0 0 1 1 6 -4 -2 0 -3 2 -1 -1 -1 1 2 -1 0 -2 -3 -1 -1 -2 5 -7 F -2...&quot;</p> <p><b>New page</b></p><div>==BLOSUM 30==<br /> &lt;pre&gt;<br /> A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z * <br /> A 4 0 -3 0 0 -2 0 -2 0 0 -1 1 0 -1 1 -1 1 1 1 -5 0 -4 0 -7 <br /> B 0 5 -2 5 0 -3 0 -2 -2 0 -1 -2 4 -2 -1 -2 0 0 -2 -5 -1 -3 0 -7 <br /> C -3 -2 17 -3 1 -3 -4 -5 -2 -3 0 -2 -1 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -6 0 -7 <br /> D 0 5 -3 9 1 -5 -1 -2 -4 0 -1 -3 1 -1 -1 -1 0 -1 -2 -4 -1 -1 0 -7 <br /> E 0 0 1 1 6 -4 -2 0 -3 2 -1 -1 -1 1 2 -1 0 -2 -3 -1 -1 -2 5 -7 <br /> F -2 -3 -3 -5 -4 10 -3 -3 0 -1 2 -2 -1 -4 -3 -1 -1 -2 1 1 -1 3 -4 -7 <br /> G 0 0 -4 -1 -2 -3 8 -3 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -2 0 -2 -3 1 -1 -3 -2 -7 <br /> H -2 -2 -5 -2 0 -3 -3 14 -2 -2 -1 2 -1 1 0 -1 -1 -2 -3 -5 -1 0 0 -7 <br /> I 0 -2 -2 -4 -3 0 -1 -2 6 -2 2 1 0 -3 -2 -3 -1 0 4 -3 0 -1 -3 -7 <br /> K 0 0 -3 0 2 -1 -1 -2 -2 4 -2 2 0 1 0 1 0 -1 -2 -2 0 -1 1 -7 <br /> L -1 -1 0 -1 -1 2 -2 -1 2 -2 4 2 -2 -3 -2 -2 -2 0 1 -2 0 3 -1 -7 <br /> M 1 -2 -2 -3 -1 -2 -2 2 1 2 2 6 0 -4 -1 0 -2 0 0 -3 0 -1 -1 -7 <br /> N 0 4 -1 1 -1 -1 0 -1 0 0 -2 0 8 -3 -1 -2 0 1 -2 -7 0 -4 -1 -7 <br /> P -1 -2 -3 -1 1 -4 -1 1 -3 1 -3 -4 -3 11 0 -1 -1 0 -4 -3 -1 -2 0 -7 <br /> Q 1 -1 -2 -1 2 -3 -2 0 -2 0 -2 -1 -1 0 8 3 -1 0 -3 -1 0 -1 4 -7 <br /> R -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -1 -3 1 -2 0 -2 -1 3 8 -1 -3 -1 0 -1 0 0 -7 <br /> S 1 0 -2 0 0 -1 0 -1 -1 0 -2 -2 0 -1 -1 -1 4 2 -1 -3 0 -2 -1 -7 <br /> T 1 0 -2 -1 -2 -2 -2 -2 0 -1 0 0 1 0 0 -3 2 5 1 -5 0 -1 -1 -7 <br /> V 1 -2 -2 -2 -3 1 -3 -3 4 -2 1 0 -2 -4 -3 -1 -1 1 5 -3 0 1 -3 -7 <br /> W -5 -5 -2 -4 -1 1 1 -5 -3 -2 -2 -3 -7 -3 -1 0 -3 -5 -3 20 -2 5 -1 -7 <br /> X 0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 0 0 0 0 0 -1 0 -1 0 0 0 -2 -1 -1 0 -7 <br /> Y -4 -3 -6 -1 -2 3 -3 0 -1 -1 3 -1 -4 -2 -1 0 -2 -1 1 5 -1 9 -2 -7 <br /> Z 0 0 0 0 5 -4 -2 0 -3 1 -1 -1 -1 0 4 0 -1 -1 -3 -1 0 -2 4 -7 <br /> * -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 1 <br /> &lt;/pre&gt;<br /> <br /> ==BLOSUM 62==<br /> &lt;pre&gt;<br /> A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *<br /> A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 0 -4 <br /> R -1 5 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -4 <br /> N -2 0 6 1 -3 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -4 <br /> D -2 -2 1 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 <br /> C 0 -3 -3 -3 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -4 <br /> Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 0 3 -1 -4 <br /> E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 <br /> G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -1 -4 <br /> H -2 0 1 -1 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 0 0 -1 -4 <br /> I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 -3 -3 -1 -4 <br /> L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -4 -3 -1 -4 <br /> K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 0 1 -1 -4 <br /> M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -2 -1 -1 -1 -1 1 -3 -1 -1 -4 <br /> F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 -3 -3 -1 -4 <br /> P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -1 -2 -4 <br /> S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 0 0 0 -4 <br /> T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 -1 -1 0 -4 <br /> W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 1 -4 -3 -2 11 2 -3 -4 -3 -2 -4 <br /> Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 -3 -2 -1 -4 <br /> V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 -3 -2 -1 -4 <br /> B -2 -1 3 4 -3 0 1 -1 0 -3 -4 0 -3 -3 -2 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 <br /> Z -1 0 0 1 -3 3 4 -2 0 -3 -3 1 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 <br /> X 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -4 <br /> * -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 1 <br /> &lt;/pre&gt;<br /> <br /> ==BLOSUM 90==<br /> &lt;pre&gt;<br /> A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *<br /> A 5 -2 -2 -3 -1 -1 -1 0 -2 -2 -2 -1 -2 -3 -1 1 0 -4 -3 -1 -2 -1 -1 -6 <br /> R -2 6 -1 -3 -5 1 -1 -3 0 -4 -3 2 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 -3 -2 0 -2 -6 <br /> N -2 -1 7 1 -4 0 -1 -1 0 -4 -4 0 -3 -4 -3 0 0 -5 -3 -4 4 -1 -2 -6 <br /> D -3 -3 1 7 -5 -1 1 -2 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -6 -4 -5 4 0 -2 -6 <br /> C -1 -5 -4 -5 9 -4 -6 -4 -5 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -4 -2 -4 -5 -3 -6 <br /> Q -1 1 0 -1 -4 7 2 -3 1 -4 -3 1 0 -4 -2 -1 -1 -3 -3 -3 -1 4 -1 -6 <br /> E -1 -1 -1 1 -6 2 6 -3 -1 -4 -4 0 -3 -5 -2 -1 -1 -5 -4 -3 0 4 -2 -6 <br /> G 0 -3 -1 -2 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -3 -4 -5 -5 -2 -3 -2 -6 <br /> H -2 0 0 -2 -5 1 -1 -3 8 -4 -4 -1 -3 -2 -3 -2 -2 -3 1 -4 -1 0 -2 -6 <br /> I -2 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -4 5 1 -4 1 -1 -4 -3 -1 -4 -2 3 -5 -4 -2 -6 <br /> L -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -4 1 5 -3 2 0 -4 -3 -2 -3 -2 0 -5 -4 -2 -6 <br /> K -1 2 0 -1 -4 1 0 -2 -1 -4 -3 6 -2 -4 -2 -1 -1 -5 -3 -3 -1 1 -1 -6 <br /> M -2 -2 -3 -4 -2 0 -3 -4 -3 1 2 -2 7 -1 -3 -2 -1 -2 -2 0 -4 -2 -1 -6 <br /> F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -5 -2 -1 0 -4 -1 7 -4 -3 -3 0 3 -2 -4 -4 -2 -6 <br /> P -1 -3 -3 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -4 8 -2 -2 -5 -4 -3 -3 -2 -2 -6 <br /> S 1 -1 0 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -2 5 1 -4 -3 -2 0 -1 -1 -6 <br /> T 0 -2 0 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -2 1 6 -4 -2 -1 -1 -1 -1 -6 <br /> W -4 -4 -5 -6 -4 -3 -5 -4 -3 -4 -3 -5 -2 0 -5 -4 -4 11 2 -3 -6 -4 -3 -6 <br /> Y -3 -3 -3 -4 -4 -3 -4 -5 1 -2 -2 -3 -2 3 -4 -3 -2 2 8 -3 -4 -3 -2 -6 <br /> V -1 -3 -4 -5 -2 -3 -3 -5 -4 3 0 -3 0 -2 -3 -2 -1 -3 -3 5 -4 -3 -2 -6 <br /> B -2 -2 4 4 -4 -1 0 -2 -1 -5 -5 -1 -4 -4 -3 0 -1 -6 -4 -4 4 0 -2 -6 <br /> Z -1 0 -1 0 -5 4 4 -3 0 -4 -4 1 -2 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 0 4 -1 -6 <br /> X -1 -2 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2 -2 -1 -2 -6 <br /> * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1 <br /> &lt;/pre&gt;</div>

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